OPC 为柱纯化,纯度约 75%,成本低,适合 HEK293、HeLa 等常规细胞系转染;HPLC 纯度 ≥90%,去除失败产物更彻底,适合原代细胞、干细胞、动物实验及拟发表的高要求数据。
常规细胞系可不修饰直接使用。以下情况建议修饰:需监控转染效率(FAM / Cy3 荧光标记)、增强血清稳定性(2'-OMe)、提升沉默效率(5'-磷酸)、促进难转染细胞摄取(5'-胆固醇)。至少推荐设置一条荧光标记对照用于监控转染。
标记在正义链 5' 或 3' 端影响很小(正义链不参与切割,RISC 装载后被丢弃);避免标记在反义链上,否则会干扰 RISC 装载与切割活性。常规监控选 FAM,多色共定位 / FRET 选 Cy3 + Cy5,活体深层成像选 Cy5.5。
siRNA / miRNA 工具在 24–48 h 可见 mRNA 变化,48–72 h 蛋白水平变化明显,效果持续 3–7 天(随细胞分裂稀释而减弱),需更久可重复转染或改用 shRNA。saRNA 起效较慢(48–96 h),mRNA 激活约持续 3–7 天,部分序列可诱导表观遗传改变并延长至数周。
存在两类脱靶:seed 区(反义链 2–8 位)与非靶 mRNA 3'UTR 部分互补引发的 miRNA 样沉默,以及序列激活 TLR3/7、RIG-I 引发的免疫反应。可通过全基因组脱靶分析排除高同源候选、在反义链 seed 区引入 2'-OMe、降低工作浓度(10–20 nM)、用多条独立序列验证表型一致性来控制。
阴性对照(NC)为无关序列,用于验证表型特异性——若 NC 组也出现变化,说明存在非特异效应;Cy3 / FAM 标记 NC 还可监控转染效率。阳性对照靶向 GAPDH 等管家基因,用于验证转染与检测体系是否正常——若阳性对照也失败,应优先排查实验条件而非靶序列。
过表达载体引入外源 cDNA(常配强启动子),表达量高但缺失天然调控,可能出现非生理水平表达;saRNA 激活内源基因,保留天然剪接、选择性剪接与翻译后修饰,更接近生理状态,适合研究基因上调后的真实功能。
针对靶基因启动子设计 4 条 saRNA,在转染效率 >80% 的条件下,保证至少 1 条使靶基因 mRNA 上调 ≥2 倍。套餐含阴性对照、FAM 标记阴性对照(监控转染)和阳性对照 siRNA(验证体系)。未达承诺并提供定量数据后,免费重新设计 4 个新靶点。