基因克隆与载体构建(cDNA / ORF 克隆、亚克隆、定点突变)

基因克隆与载体构建(cDNA / ORF 克隆、亚克隆、定点突变)

cDNA 克隆和基因合成有什么区别?
<p>cDNA 克隆以已有 cDNA 模板(文库或现货质粒)为起点,经 PCR 或酶切获取片段后连入载体,成本更低、周期更短,但依赖模板可用性;基因合成无需模板,可做密码子优化和任意序列定制。有现货模板选克隆,需改序列或无模板选合成。</p>
cDNA 克隆和 ORF 克隆怎么选?

cDNA 克隆获得含 5'/3'UTR 的全长转录本,通常连入克隆载体,用作 PCR 模板、测序模板和基因功能研究,需再亚克隆才能表达蛋白;ORF 克隆只取 ATG 到终止密码子的编码区,连入 pCMV 等表达载体并含 Kozak 序列,可直接转染细胞表达蛋白。做蛋白表达选 ORF,要基因模板选 cDNA。

亚克隆和 PCR 克隆有什么区别?

亚克隆是把已有质粒上的片段通过酶切或 PCR 切下后重新连入新载体,适合换载体、加标签、换启动子;PCR 克隆是从 cDNA、基因组 DNA 或质粒模板直接扩增目的片段后克隆,适合从样本中首次获取基因。基因已在现货库中时,亚克隆更快捷经济。

可以使用我自己提供的载体吗?

可以。需提供载体完整序列(建议已测序验证)、图谱或抗性/拷贝数信息,并说明期望插入位点;序列不全时可寄送质粒或甘油菌由我们测序验证。若用到特殊内切酶,可您提供或我们代购。没有合适载体时,可从 200+ 种免费载体库中选用。

你们的克隆技术与我自己用限制性内切酶做有什么不同?

我们采用同源重组(无缝克隆)技术,不依赖载体与片段的匹配酶切位点,可将片段插入任意载体的任意位置,一次反应完成定向克隆,无需多步酶切-连接,阳性率高,尤其适合酶切位点不匹配、大片段及多片段拼接。

定点突变的成功率有多高?一个“突变单位”怎么算?

常规序列(GC 正常、无复杂二级结构)单点突变成功率接近 100%,多点或复杂模板会先做评估并沟通方案,全部经 Sanger 测序验证后交付。一个突变单位指同一条引物覆盖范围(约 30 bp 窗口)内的任意碱基改变:单碱基替换、连续 3 bp 改一个密码子、插入 10 bp 标签、删除 20 bp 片段各计 1 处;两位点相距较远需两对引物则计 2 处。

克隆和突变项目的周期多久?

常规克隆 <2 kb 约 1–7 个自然日,2–3 kb 约 7–12 天,3–4.5 kb 约 12–15 天,4.5–5 kb 约 15–20 天。单点突变 1–10 天,双点突变 10–25 天(视质粒大小),多处突变按位点数量与间距评估。难度序列或使用特殊载体/宿主时周期适当延长。

模板序列没有测序过怎么办?

建议先做全质粒测序确认序列,再进行克隆或突变。模板本身若存在未知突变,会导致克隆或突变结果错误且难以排查。全质粒测序可交由我们一站式完成。

大于 5 kb 的基因能克隆吗?

可以,属于难度项目。我们会根据 GC 含量、重复序列、二级结构等做专项评估并给出定制方案。大片段通常建议采用基因合成(无需模板,可同步密码子优化),或从 BAC/PAC 等大片段载体通过同源重组获取。

Copyright © 上海质因生物科技有限公司 版权所有 备案号:沪ICP备2026030105号-1